Apple Watch SE sử dụng chip S5 như Apple Watch Series 5 và chia sẻ các tính năng thiết yếu với Apple Watch Series 6, chẳng hạn như cảm biến gia tốc, con quay hồi chuyển, máy đo độ cao, phát hiện ngã, theo dõi giấc ngủ và SOS khẩn cấp. Đồng hồ chạy WatchOS 7 và tương thích với tất cả dây đeo của Apple Watch, cũng như hỗ trợ chống thấm nước . Apple Watch SE tùy chọn 2 kích thước màn hình (40mm và 44mm). Tích hợp dung lượng: 32GB, tùy chọn 2 Phiên bản (GPS và GPS + Cellular).
Apple Watch SE trang bị màn hình LTPO nhưng nó không được tích hợp Tính năng Always On, tính năng này giúp hiển thị thời gian cùng với ứng dụng hoạt động gần đây nhất và mặt đồng hồ, vì vậy việc thiếu trang bị màn hình Always On trên Watch SE có thể là một yếu tố ảnh hưởng đến quyết định mua sản phẩm của người dùng.